“姐姐，甲板上的情况怎么样，我怎么感觉海上的风暴好像越来越大了。”一向沉稳冷静的少女声音里也有了几分焦急。
“大君，我们还是在向奇迹岛行驶吗？”文静的年轻女子此刻的声音里也充满了惊慌。
“诸星先生，风浪太大，船上的桅杆好像快倒了，怎么办？”在甲板上调整风帆的师傅也一时不知所措。
与船上其它三人焦急而惊慌的声音相比，驾驶室里年轻男子的声音一如既往的冷静厚重，给人一种心安的感觉，“两位小姐不要着急，现在的情况不太妙，但终归有办法的。别紧张，俯下身子，我们要调转船头了。”
年轻男子一边在掌舵，一边密切注视着狂风呼啸的大海，当海面稍微平静的时候，他竭力把握住船的航行方向，当海浪打来时，他轻盈地调整航向避过浪头，防止船被海浪掀翻。
这是三月上旬一个傍晚日本东京湾附近某片海域传来的对话，一艘有着两面风帆，装有柴油发动机的蓝色小游艇在风暴肆虐的大海上顽强地经受着海浪的洗礼。
（作者解释：东京湾，是一个位于日本关东地区的海湾，因与东京接壤而得名，古称江户湾，东京湾有多摩川、鹤见川、江户川、荒川等多条河流注入。近代以来，东京湾内开始了海堡的建造，所以湾内有很多人工岛。）
蓝色的游艇上有四个人，坐在船舱里的两位少女分别是南洋大学大二女学生宫野明美和她的妹妹，年仅十五岁，却有着丝毫不逊于成人成熟的宫野志保；站在甲板上调整风帆的是一位姓山田的中年师傅；最后一位是在驾驶室里淡定地驾驶着游艇与风浪搏斗的男青年，他的名字叫赤井秀一，是FBI（美国联邦调查局）新人特工，不过他现在的身份是日本南洋大学化学研究生诸星大。
为什么在这个台风呼啸的夜晚，赤井秀一和宫野姐妹会乘坐小游艇在海面上游弋？这一切还要从头说起。
一年前，刚刚成为FBI特工的赤井秀一终于如愿被派回了日本执行任务，直面导致他家破人亡的黑衣组织。按照FBI为他制定的作战计划，他先以南洋大学研究生诸星大的身份，接近一位黑衣组织边缘成员，南洋大学大二女学生宫野明美，然后在通过明美结识她的妹妹，年仅十四岁就因其在化学和生物制药方面的突出才能而成为黑衣组织药物研究员的天才少女，代号Sherry的宫野志保，再以宫野姐妹为介绍人，加入黑衣组织成为FBI监视组织动向的卧底。
（作者解释：在《名侦探柯南》动漫里，黑衣组织的惯例是组织BOSS会给每一名组织中高级干部赐予一个酒名作为代号。）
事情的进展比他想象得还要顺利，通过一场人为制造的“车祸”，他成功博得了宫野明美的好感，随后几次恰到好处的“英雄救美”，让他阴差阳错地成为了明美的“男朋友”，以“姐姐的好朋友”的身份获得了明美的妹妹志保的信任，成功卧底黑衣组织。
虽然已经卧底黑衣组织近一年的秀一目前还只是组织罪基层的行动人员，也没有太多机会接触到有关组织的重要情报，但是在这一年的时间里，秀一已经通过各种手法结识、收买和利用组织大大小小的干部们，旁敲侧击地从他们口中获取可能有价值的一切情报，有意无意展示自己在射击、搏击和化学等方面过人的才能，在组织初步建立起一套属于自己的关系网。
而现在关系网开始初步发挥作用了，三天前的下午，在秀一与宫野姐妹合租的高层公寓的客厅里，明美面色凝重地将一个信封交给了正在喝下午茶的秀一，“大君，刚才Bourbon来找我，说是组织为了考验新人，让你来执行这样一项任务。”
（作者解释：Bourbon，原名安室透，9岁，黑衣组织的侦探，曾经是警视厅警察学校第一名毕业的学员，收集情报能力极强。在本系列柯南同人文中，他是日本警方在黑衣组织的卧底。）
秀一打开信封，仔细看了看里面的内容，用特制的点烟器缓缓点燃一支薄荷味的香烟，默默地盯着挂在墙上的日历，半晌沉默不语。
看到秀一沉默的样子，明美有些担心地说，“大君，如果实在不方便的话，你也不要勉强自己，我可以再去和Bourbon商量一下。”
“到底是去还是不去，如果你还是个男人的话就请干脆一点，你没有看到姐姐已经很为难了吗？”茶发少女直截了当对秀一说道，尽管这一年来“诸星大”对自己和姐姐颇为关照，自己也开始慢慢接受他，但是志保心里始终对这个身份来历均不明，突然闯进自己和姐姐生活中的“不速之客”有一种隐隐约约的不安和危险的感觉，当然后来的事实证明她的第六感惊人的准确。
秀一赶紧解释道，“我不是不想去，而是在思考应该怎么去完成这个任务。”
“这个任务到底是什么，你还没有告诉我们呢。”志保的声音有些无奈。
“是这样的，组织让我协助一位刚从美国回来的组织成员Liqueur，与一位名叫麦利亚托的意大利商人进行情报交易。”不知为什么，作为FBI特工的赤井秀一，在宫野志保这个十五岁的少女面前，总是显得有点弱势。这究竟什么原因，秀一自己也百思不得其解，唯一可以明确的是，这里面大概是夹杂了很多从过去到现在的复杂的感情因素。
（作者解释：Liqueur，利乔酒，因大多为浓稠甜腻，所以也可称为香甜酒和甜露酒。其制造方法是采用酿制或蒸饮馏类原酒作为基酒，再添混必所需材料，而形成所添混物之特色的酒。利乔酒约可分为果实和药物两种类型，前者如可可酒、樱桃酒等等。后者则属饮疗保健用途，且多为世传独门秘方，很多以家族名称命名，如爱尔兰迷雾、君度等等。）
“什么时候去执行任务，交易地点在哪里？”志保追问得滴水不漏。
秀一老老实实地回答，“三天以后，就是这周六，地点是东京湾附近的奇迹岛，那里原本是一个无人荒岛，不过半年前被那个意大利商人买下来了，在那里建了私人别墅，所以他和组织约在他的别墅里进行交易。”说到这里秀一有点歉意，“本来这周六是想陪你们姐妹俩到秋叶原去逛街的，现在看来是没有时间了。”
（作者注释：秋叶原，是日本东京的秋叶原世界上屈指可数的电器街，除了电器商品专卖店之外，还拥有多家电子游戏和动漫产品专门店，商务、饮食等服务功能也十分齐全，现在已经发展成为一个具有综合性色彩的繁华区域。）
到底是十五岁的单纯少女，看到一面愧疚的秀一，志保的语气也缓和了很多，“我们三个一起出去玩不一定非要去商业街，一起去海岛呼吸一下新鲜空气也不错嘛。要不你带上我和姐姐也一起去奇迹岛吧。”
志保大胆的提议把秀一和明美都下了一跳，明美立刻轻声斥责道，“志保，不要太任性了，大君是去执行组织重要任务的，又不是出去旅游，怎么能带上我们一起去呢？”
志保自己也感觉到刚才的提议有些不妥，悻悻地低下了头，“对不起，是我想得太简单了。”
“没关系的，志保的提议也有一定道理，我们三个去哪里玩都可以，这次任务也不算太复杂，就当我们三个一起去海岛旅游也未尝不可嘛。”之所以或同意志保的要求，给自己的卧底行动加入不确定的变数，完全是秀一复杂的私人感情，这其中既有对利用宫野姐妹卧底打入黑衣组织的愧疚，更有对她们，特别是被迫承受了她这个年龄不该承受了很多东西而显得异常成熟的志保的关爱和怜惜。
自幼失去父母，被黑衣组织收养的宫野姐妹，姐姐明美尚能和父亲生前的好友一起生活，除了偶尔受到组织的监控，大部分时间还能够像普通的同龄女孩一样过着正常的生活，而妹妹却因为其在化学和生物制药方面过人的天赋，从小就在组织严密的监控下，按照组织的安排生活，虽然年仅十四岁就取得了化学和生物制药双学士学位，但是她在个人生活可谓是十分单调乏味，几乎从来没有像正常的孩子一样享受过童年的欢乐。由于从小目睹了黑衣组织内部成员的之间残酷的争权夺利的斗争，她的性格十分谨慎，除了姐姐之后，从不轻易相信他人，就连秀一也花了近一年的功夫才取得了她的基本信任，因此在某种程度上，年幼的志保还是相对天真单纯的姐姐宫野明美的保护神。难得可贵的是，即使在这种氛围下长大，志保还是保持了直率和善良的天性。因此对志保这个早熟的女孩，秀一有一种近似乎于宠溺的感情，也正是因为如此，当看到志保为一些对年轻貌美的姐姐纠缠不休组织的男成员感到十分头疼的时候，秀一挺身而出，自称是明美的“男朋友”，让宫野姐妹住进了自己租住的高层公寓，不让那些好色之徒再有机会去骚扰宫野姐妹。不料志保因此真的把自己当成了“准姐夫”来看待，这让秀一一时不知如何解释。
没想到秀一居然真的同意了志保近似于胡闹的提议，这让宫野姐妹十分惊讶，两人几乎是异口同声地问，“我们和你一起去奇迹岛，这样真的可以吗？”
看到秀一微笑着点了点头，姐妹俩立刻去收拾准备行李，兴奋之情溢于言表。
到底还是少女，还是处在爱玩的年龄。望着高兴的宫野姐妹，秀一也感到一种久违的属于家庭的温馨感，不过很快他就让自己回归到FBI卧底特工的角色，继续研究如何完成组织指派的任务。
在三人准备出发前往奇迹岛的前一天中午，刚刚睡完午觉的宫野姐妹就看到秀一拧着一只巨大的行李箱回来。
“大君，这箱子里装得是什么？”明美好奇地问。
秀一得意地拍了拍箱子，“这个是水手专用的行李箱，里面都是海上生活必备的东西！”
“呵，还挺神秘的样子！”志保表面上一副不以为然的样子，心里却也对箱子里的东西很好奇。
明美突然想起了什么，拿起一封信递给秀一，“这个是今天早上我在信箱里看到的，是你的信。”
秀一打开信看了一眼，微微一愣，然后微笑着说，“原来是催缴电费的单子啊，哎，看来最近又要破费了。对了，你们的行李收拾得怎么样了，让我看看吧。”
其实，那张所谓“催缴电费的单子”真实内容如下：
“来自幽灵水手的警告：切勿前往奇迹岛，否则有去无回。”