七月初三，赵佶于宴春阁夜晏朝中百官。
七月初四，赵佶亲自主持廷议，裁撤兵部，改组枢密院，亲领枢密使一职，由五位枢密副使主持，左右相兼领枢密副使一职。其余三位枢密副使主持日常事务，分主军备军需、募兵整训中下级军官选任、军功军纪、军情谍报之事，战争事务、军队调动换防与副军将以上选任等重大事务由枢密使召集五位枢密副使联席议定。枢密院另设参谋司，选任致仕军中将领与有实战经验的在任将领，负责战役筹划战术参详。侍卫亲军马步军与厢军归入枢密院，改为中央军与战备军，乡兵归入地方官府，殿前司仍直接对皇帝负责。
枢密院按职司下设五司十六房：选锋司，负责招募兵训兵以及中低级军官选任。兵备司负责兵器制造与设计、储运等事务，军需司负责平时与战时物资保障事务，赏罚司负责军功奖励与处置官兵不法违律之事，机宜司负责刺谍与反刺谍之事。
禁军改组的中央军划分为四大战区，北方战区，西方战区，东南战区与中央卫戍区。北方战区辖河北河西河东路三路，驻中央军北方军团十五万人，西部战区辖永兴军路、秦凤路、成都府路，驻中央军西方军团二十万人，中央卫戍区辖京东东路、京东西路、京西北路，驻中央军团十万人。余下诸路皆入东南战区，驻中央军十万人。各地水军归入所驻守战区。
北方战区以刘法为兵马使，折可适为兵马副使，西方战区以种师道为兵马使，西军名将郭成为兵马副使。
徐衡为枢密院副使，刘仲武迁枢密院副使，另一名枢密院副使则由氓州知州何灌升迁。
四十五岁的开封府人何灌称得上是一位文武双全的传奇人物，武举出身，不仅在军中负有盛名，治理地方更是政绩斐然。
何灌天生神力，射术直追三箭定天山的唐时名将薛仁贵与箭入石中的汉代名将李广。曾以三箭，箭箭没入山崖石中，惊退辽人。又用二箭，皆穿二名带甲夏兵，吓退夏军。
何灌领枢密院副使，同时领中央卫戍区副兵马使一职，主持军务。中央卫戍区兵马使由皇帝亲领。
中央军取消所有军号，以五万为军，设军帅，重立军号，以万为军，设军将，改以数字为列，以二千五为旅，设旅率，改以数字为列，以五百为都，设都率，以百人为营，设营率，以十人为队，设队率。水军各军依新制改编，军号不变。所有军帅、军将正副职由各战区议定，报枢密院联席廷议审察，旅都营正副率由各战区拟定，报选锋司审察。
北部战区授武进、武威、武胜军号，中央卫戍区授龙吟、虎啸军号，东南战区授定远、定安军号，西部战区授威德、威昭、威信、威扬军号。每万人军装备火器一旅，配备三都火炮，二都火铳。
战备军主官仍由各州钤辖统领，报枢密院审察，兵员数由枢密院核定，除袭旧例外，北方战区与西方战区数量可据情增加，报枢密院选锋司审察。
殿前司改编为龙骑、虎威、神火三军，龙骑三万人，神火二万人，亦设军帅，虎威五万人，主官仍为正副都指挥使。
朝廷令各战区须于九月之前完成各军改建与驻地战守之责划分工作，呈报枢密院。
赵佶又于同日诏令改组朝廷与各路机构职司，取消御史台，改设谏部，取消三省，设政务院，由左右二相领之，设五位政务大臣，辖户部、财部、吏部、工部、礼部、刑部、谏部，原户部的赋税征收与库用收支划归财部，通商事务划归户部。各路设三司，承宣布政使司管理行政事务，提刑按察使司管司法，服从于刑部与谏部，都按察使司管军事，管理各路战备军，服从于枢密院，各州县暂袭旧制。
鉴于北方与西北战事频繁，两地各路都按察使由驻扎该路的军帅兼领，两地乡兵亦归其统领。
大理寺于政务院刑部、监察部之外，负责全国各地重大刑案的复核审察与死囚案复核审察，可视情于各路设分衙，但须呈皇帝准允。
各地廉访司与镇抚司分衙直属廉访司、镇抚司，对皇帝负责。
至此，政务院行政，枢密院管军，大理寺审司法，廉访镇抚两司为耳目，又有殿前司与皇城司亲从官为用，赵佶将自己大致的治国思路慢慢铺展开来。